Gli endoscopi sono classificati in base alla loro funzione
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1. Endoscopia del tubo digerente: esofagoscopio a tubo rigido; esofagoscopio a fibre ottiche; esofagoscopio elettronico; esofagoscopio elettronico a ultrasuoni, gastroscopio a fibre ottiche, gastroscopio elettronico, gastroscopio elettronico a ultrasuoni, duodenoscopio a fibre ottiche, colonscopia duodenale elettronica, enteroscopia a fibre ottiche, enteroscopia elettronica, colonscopia a fibre ottiche, colonscopia elettronica, sigmoidoscopia e proctoscopia a fibre ottiche.
2. Endoscopia per le vie respiratorie: laringoscopio a tubo rigido, laringoscopio a fibre ottiche, laringoscopio elettronico, broncoscopio a fibre ottiche, broncoscopio elettronico, toracoscopio e mediastinoscopio.
3. Endoscopio per cavità peritoneale: ci sono il tipo a tubo rigido, il tipo a fibra ottica e il tipo a chirurgia elettronica.
4. Endoscopia delle vie biliari: coledocoscopia a tubo rigido, coledocoscopia a fibre ottiche, coledocoscopia elettronica e coledocoscopia bambino-madre.
5. Endoscopia per il sistema urinario: (1) Cistoscopia: può essere suddivisa in cistoscopia per ispezione, cistoscopia per intubazione ureterale, cistoscopia per chirurgia, cistoscopia per insegnamento, cistoscopia per fotografia e cistoscopia per bambini e cistoscopia femminile. (2) Ureteroscopia. (3) Nefroscopia.
6. Endoscopia per ginecologia: colposcopia e isteroscopia.
7. Endoscopia dei vasi sanguigni: endoscopia endovascolare.
8. Endoscopia delle articolazioni: artroscopia.

